Sin dai suoi inizi la Chiesa Neo-Apostolica si è definita come Chiesa del ministero. È una Chiesa diretta dall’apostolato.
Dall’apostolato procedono tutti gli altri ministeri. Il quinto articolo della professione di fede dichiara: «Credo che coloro che Dio ha scelto per esercitare un ministero, ricevono l’investitura unicamente dagli apostoli e che dal ministero d’apostolo procedono il potere, la benedizione e la santificazione necessari all’esercizio del loro ministero».
Oggi nella Chiesa Neo-Apostolica ci sono tre livelli ministeriali con competenze spirituali differenti:
il ministero d’apostolo
sommoapostolo, apostolo di distretto e apostolo;
il ministero di sacerdote
vescovo, anziano di distretto, evangelista di distretto, pastore, evangelista di comunità e sacerdote;
il ministero di diacono
diacono e suddiacono.